Для крафта на ядре слияния нужно поставить в центре ядро слияния ( как показано на скрине ). По бокам нужно поставить такое количество инжекторов слияния, сколько требуется в крафте предметов, можно больше инжекторов слияния, меньше никак не получиться т.к нужно же куда то выкладывать вещи.
После нужно подвести энергию ко всем инжекторам слияний, они работают на энергии же. И после этого нужно выкладывать все предметы которые нужны для крафта, если установлен CraftTweaker посмотрите на крафт в JEI. В ядро слияния также нужен предмет который написан в крафте. Когда все выложили можно начинать крафт, для этого нужно зайти в ядро слияния и нажать на кнопку Начать. Энергия потратиться, вещи пропадут и получится один предмет который вы крафтили или улучшали.
Инжектора слияния можно ставить и в другом порядке, друг на друга или все в одной стороне, главное чтобы они были подключены к подаче энергии.