Значит, выделение не считывается.
Не знаю что за ядро «Banner» (и причём тут флаги), но, учитывая:
могу предположить, чтобы ПЛАГИН MultiverseCore мог работать с WorldEdit, — WorldEdit тоже должен быть ПЛАГИНОМ на том же загрузчике плагинов, а не МОДОМ.